2017年国务院63号文“国务院办公厅关于深化医教协同进一步推进医学教育改革与发展的意见”强调了医学教育在国家标准的指导下的临床教学基地建设和资源整合利用。临床医学专业教育100年的传统就是社会医疗资源用于专业人才培养，而我们学校聚焦“应用性、特色型、国际化”的定位，应用型人才岗位胜任力的培养就更加需要在医院、在实际场景、在病人身边、跟随医师成长。临床医学院以“加强顶层设计、坚持上海标准、优势资源整合、拓展国际合作”四个方面着手，为医学生培养创建优质资源，为培养明日好医生打下基础。
一、加强顶层设计，提供实践教学资源
统筹进行专业建设和临床教学基地建设:临床医学院目前有三个专业和方向，经过3年的逐步调整，到目前为止，已经形成了“学院-卫健委-医院”的临床教学基地模式，包括：（1）本科教学以三级综合性医院为主，在市卫健委的部署下，与区卫健委协同育人；（2）专科乡村医学专业，与区卫健委协同，区县综合性医院为主；（3）专科院前急救方向，则与市急救中心、市区二级综合性医院形成“1+1+1”的合作模式。
学校为了加强学生的能力培养，构建了临床医学专业实践能力培养体系及先进的实验实践教学条件，包括：（1）基础医学互动学习中心、动物外科实验室、临床基本技能训练中心、实践教学中心以及各医院的医学模拟教学中心，为医学生提供了优质的教学条件。
二、坚持上海标准，进行临床教学基地建设
上海市卫健委规范化培训事务中心有一批高水平的临床医学教育专家，我们在临床教学基地建设过程中，邀请这些专家们参与标准制定、过程评价、反馈整改，包括课程教学团队建设、试讲、集体备课、教学查房、示范病区建设等。另外，我们也借助上海交通大学医学院、复旦大学上海医学院、同济大学医学院、海军军医大学的师资，进行我校的整合课程体系和PBL体系建设。
三、资源整合，进行专业和学科建设
全科医学是我们的特色，而我们并没有在国内外有影响力的全科医学专家，但是，我们利用上海市全科医学教育与研究中心这个平台，整合了上海市最优秀的全科医学专家资源，尤其是中山医院的全科医学团队，同时集成好我校附属医院和社区卫生服务中心的全科医学团队，去年就是这样的团队，我们圆满完成援疆扶贫医疗队工作。这支整合团队，也将在医学教育中发挥作用。下一步，将使用好专家资源，以国家标准建设我校附属医院的全科基地和社区卫生服务中心。（附属社区卫生服务中心标准修订）
四、拓展国际合作，借道发展
学院积极拓展国际合作资源，建立了与比利时列日大学、比利时鲁汶大学、法国斯特拉斯堡大学、英国伦敦大学的密切合作，开展了“中比医学科学硕士本硕”项目，“中法全科医师综合能力培训项目”以及欧洲国家的海外游学。
2016年，我们迎来第一批临床医学本科，学校充分利用了与法国和比利时的友好关系，整合上海市法语教育专家力量，利用比利时列日大学的皇家院士资源，经过近4年的努力已经取得阶段成果。目前，5名2016年级学生已经获得比利时列日大学录取，并成功注册医学科学硕士二年级；2017年级7名医学生获得比利时列日大学医学科学硕士一年级的录取。
五年来，学院已形成一支优秀的师资团队、一批高水平临床教学基地和丰富的国际教育教学资源，为培养明日好医生打下了坚实基础。