一、附属医院
拥有六院东院、六院南院、嘉定区中心医院、周浦医院、浦东新区人民医院5所附属医院，分别牵头内科学系、外科学系、妇产科学系、儿科学系、全科医学系。拥有一批高水平的医学专家、临床医学研究的临床科学家、能够应用先进教学手段的教学专家。
二、社区联盟教学基地
为切实落实临床医学专业人才培养方案，推进全科医学学科发展，进行全科医学人才培养特色的社区教学基地建设，完善学校-附属医院-社区联盟的临床教学体系，我院与六家社区卫生服务中心签约，共建临床医学院“社区联盟教学基地”。这六家社区卫生服务中心分别是嘉定镇社区卫生服务中心、马陆社区卫生服务中心、浦东新区川沙卫生服务中心、康桥社区卫生服务中心、浦东新区合庆卫生服务中心、书院社区卫生服务中心。
三、国外教学基地
本着“优势互补、资源共享、互惠双赢、共同发展”的原则，临床医学院与里昂一大医学院，芬兰SAVONIA大学建立了长期、紧密的合作关系。
四、临床技能实训中心
建有现代化的临床技能实训中心，引进美国心血管病协会的国际课程，并拥有一批获得美国心血管病协会认证资格的急救训练课程导师。
